Согласно ст.200 Гражданского кодекса Российской Федерации (ГК РФ) течение срока исковой давности начинается со дня, когда лицо узнало или должно было узнать о нарушении своего права.

По обязательствам, срок исполнения которых не определен либо определен моментом востребования, течение срока исковой давности начинается с момента, когда у кредитора возникает право предъявить требование об исполнении обязательства.

В силу ст.12 Бюджетного кодекса Российской Федерации (БК РФ) финансовый год соответствует календарному году и длится с 1 января по 31 декабря.

Суды установили, что денежные средства на компенсацию указанных льгот перечислялись обществу "Транс-Сервис" из средств федерального бюджета, а поскольку нормативный акт о бюджете действует в течение календарного года, финансирование расходов по компенсации льгот могло быть осуществлено в любой период времени в пределах финансового года.

Если законом, иными нормативными правовыми актами не предусмотрены сроки компенсации расходов, понесенных организацией в связи с предоставлением отдельным категориям граждан льгот, установленных действующим законодательством, течение срока исковой давности по требованию о взыскании с публично-правового образования на основании статей 16 и 1069 ГК РФ убытков, возникших в связи с неисполнением обязанности по этой компенсации, начинается не ранее окончания финансового года, в котором была предоставлена льгота, то есть с 1 января года, следующего за отчетным.

Таким образом, о нарушении права на возмещение компенсации за предоставление льгот в 2006 и 2007 годах общество "Транс-Сервис" могло и должно было узнать по окончании соответствующего финансового года - то есть не позднее 01.01.2007, 01.01.2008. С этих дат согласно ст.200 ГК РФ и с учетом положений ст.12 БК РФ следует исчислять срок исковой давности по требованию, заявленному истцом.